Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC142Q17RM4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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