Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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