Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HADHQ16836 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HADHQ16836 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HADHQ16836 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HADHQ16836 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HADHQ16836 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HADHQ16836 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HADHQ16836 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HADHQ16836 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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