Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms