Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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