Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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RABEP1Q15276 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RABEP1Q15276 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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