Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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