Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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