Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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COL4A6Q14031 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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COL4A6Q14031 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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COL4A6Q14031 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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COL4A6Q14031 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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COL4A6Q14031 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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