Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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