Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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