Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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DNASE1L3Q13609 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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DNASE1L3Q13609 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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