Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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C1orf61Q13536 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C1orf61Q13536 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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