Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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