Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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