Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TCOF1Q13428 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCOF1Q13428 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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