Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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