Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENBP1Q13228 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms