Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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