Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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CHAF1BQ13112 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CHAF1BQ13112 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CHAF1BQ13112 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CHAF1BQ13112 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CHAF1BQ13112 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CHAF1BQ13112 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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