Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GPS1Q13098 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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