Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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