Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms