Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms