Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLEQ07864 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms