Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms