Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms