Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms