Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms