Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms