Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms