Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms