Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms