Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms