Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CLDN15P56746 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CLDN15P56746 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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