Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms