Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB3P54284 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms