Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA2P51531 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms