Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms