Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms