Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms