Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RXRBP28702 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRBP28702 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRBP28702 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRBP28702 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRBP28702 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRBP28702 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRBP28702 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRBP28702 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRBP28702 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRBP28702 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRBP28702 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRBP28702 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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