Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms