Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA5P28066 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms