Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD27P26842 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD27P26842 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD27P26842 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms