Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms