Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHCGRP22888 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHCGRP22888 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms