Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2P22307 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2P22307 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2P22307 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2P22307 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2P22307 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2P22307 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2P22307 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2P22307 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms