Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD247P20963 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms