Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms